1.网店店主面临洗牌
在网络卖家一方，反对声音主要来自小本经营的网商。他们通常有两个特点：在全国性的交易平台经营电子商务、出货量小且单件利润低。由于网络商品本身利润微薄，申办执照将增加经营成本和竞争成本，这类兼职网商很有可能退出C2C市场。
尽管《意见》中并没有税收方面的说明，但北京市工商局特殊交易监督管理处处长王靖接受媒体采访时表示，依法纳税是每个公民应尽的义务，网商也不例外，鉴于我国的电子商务监管现在仍处于起步阶段，税收问题暂时搁置，但不排除今后相关部门会推出关于电子商务税收的政策。他认为税收问题无可避免，它是电子商务市场成熟的标志。
“办理执照和缴纳税收的花费最终肯定会转嫁到商品上，真的实施起来，我就不会开店了。”淘宝店主胡女士向记者抱怨，她在淘宝上主营手机、游戏充值卡，“本来一张卡就赚几角钱，把这几百元费用平摊上连几角都没得赚了。”
受到冲击的还有学生店主，他们大约占4000万网商的30%。许多学生店主表示，因为住在学校宿舍，没法提供房屋的使用权证明，亦无法办营业执照，该《意见》实施后，就只能关门歇业。
而一些大中型网商则非常支持相关政策的出台，淘宝上多位皇冠级卖家均认为，这次洗牌有利于建立更加完善的信用体系，随着一些不具备经营实力的小型网商的出局，大中型网商也将从他们手中获得新的市场增长空间，为C2C市场注入新的活力。
近日多位站出来反对新规的业内专家则普遍认为，北京工商局此次出台新规的出发点是好的，但有鉴于中国电子商务处于起步阶段，因此应该以引导为主。
电子商务专家、武汉大学经管学院黄敏学教授称，网上交易很多是跨地区完成的，而新规只是一项地方性法规，因此执行难度颇大。
他介绍，在国外C2C交易采取备案制，即个人对自己的行为负责，也不征税。“电子商务刚刚挺过寒冬，宜放水养鱼，而不是杀鸡取卵。”他说，在中国严峻的就业形势下，大约10%的网商以开网店养家糊口，过早纳入管理，不利于培育网络购物市场。
互联网分析师吕伯望表示，北京市工商局出台的这一《意见》不符合当前互联网发展的现实，会对当前的C2C市场以致命的打击，建议政府撤回这一政策，提高电子政务水平，以合适的方式对C2C网购市场进行监管。
2.网上交易存在风险
一石激起千层浪。该《意见》的下发引起巨大的争议，社会各个群体反响不一，从专家学者到网店经营者，莫衷一是。有消息称，因指责多过于赞同，给北京工商局造成了巨大的舆论压力，北京市工商局或将取消网店须注册营业执照的规定。
但北京市工商局工作人员吴先生7月24日对《法制周报》记者表示，该意见一定会在8月1日实施，北京工商局已不会再对此作出任何回应，一切等该《意见》实施一段时间以后再说。
众所周知的是，受制于国内整体电子商务环境的影响，个人诚信问题在C2C电子商务网站上十分明显，网络诈骗、网络传销层出不穷；许多卖家在网络上销售的货物涉嫌侵权盗版，涉及知识产权的问题也非常严重。
尽管如淘宝等网站一直致力于诚信安全方面的建设，引入了实名认证制，区分了个人用户与商家用户认证，并且引入了信用评价体系，推出了名为“支付宝”的付款发货方式，以此来降低交易的风险，但仍有不少人有在网上购物被骗的经历，因在网上购物被骗的新闻也屡屡见诸报端。
据《城市晚报》报道，18岁的小陈在吉林长春桂林路一家冷饮店做服务员。6月29日，小陈在淘宝网上看到有人正在出售两辆崭新的折叠自行车，自行车别致的外形立即将小陈吸引住了，一看价钱，两辆自行车售价660元，这比市场价要便宜一半。
“当时我就决定要买下它。”小陈说，之后她与卖主通了电话。卖主是一名男子，姓任，在浙江永康市。任某让小陈将660元钱汇入他的银行账户，7月2日，小陈将辛苦攒下的一个月工资汇出。原本7月15日就应该收到自行车，可小陈却没有收到，而卖主也联系不上了。
有消费者认为，在网上购物觉得方便实惠，但往往对卖家的说法不够放心。网店办证以后，诚信上起码有了保障，不会乱写广告做夸大甚至虚假宣传，以后受骗也有地方可以投诉，对消费者来说是多了一层权益保障。但亦有消费者担心，网上购物之所以价格广受青睐，最主要是因为其低廉的价格，网络卖家需要办理营业执照之后，必然会提高商品价格，使得廉价商品无处可寻了。
3.诸多实施细节尚不明朗
值得注意的是，尽管《意见》的实施已经进入倒计时阶段，许多细节问题却令人颇感茫然。
按照新的规定，需要获得执照的网店店主地域范围在北京市，由于互联网的跨地域性，如何界定属地注册存在技术上的难题，而且全国其他省份并没有实施网店执照的规定，很难确定卖家是在北京还是在其他城市卖东西。
连在北京工商局大厅负责咨询的工作人员也表示不清楚办理网店执照的细节。根据《21世纪经济报道》7月24日刊载的文章，该报记者于7月22日在北京工商局大厅询问电子商务网店如何申请营业执照，负责咨询的工作人员称还没有接到实施细则的通知，不清楚具体细节。
此前北京市工商局表示，目前已有技术跟踪和认定这些主体，并且可以查到一家处罚一家，但并没有透露具体的技术。
此外，《意见》规定，在互联网上出售、置换自用物品，且不以赢利为目的的个人可以不重新登记注册或不登记注册。
而北京市工商局特殊交易监督管理处处长王靖对如何界定“以赢利为目的”的解释暧昧不明，他在接受媒体采访时表示：“我比较主张根据交易双方接受程度和基本判定作为界定标准，并将主动权交还市场”。
